腸道內的菌群不僅是自身產生的，還包括從外部攝入的微生物。在出生后不久，人體就開始接觸和攝入微生物，如母乳、空氣、食物和環境中的微生物等。這些微生物進入人體后，在腸道內形成了一個復雜的生態系統，稱為腸道菌群。人體的免疫系統通過與這些微生物交互來保持健康和平衡。人類的腸道菌群是由自身產生的微生物和從外部攝入的微生物組成的。