最危險的細菌之一是鼠疫菌（Yersinia pestis），它是導致鼠疫的病原菌。鼠疫曾經在14世紀造成了大規模的死亡，被稱為黑死病。其他危險的細菌包括肺結核桿菌（Mycobacterium tuberculosis）和致命性的沙門氏菌（Salmonella typhi）。