便常規不能直接查出腸道菌群的失調情況。便常規主要是通過檢查便樣中的各種成分、細菌、寄生蟲等，以了解腸道健康情況。腸道菌群失調是指腸道菌群的組成和平衡發生了改變，而便常規無法直接檢測每一種菌的數量和種類。為了確定腸道菌群失調，可以通過糞便微生物組測序（16S rRNA測序等）來檢測腸道菌群的組成情況。還可以通過血液和糞便中的生物標志物（如血液中的白細胞計數和C-反應蛋白，糞便中的卡爾波氏菌素E、乙酰膽堿酯酶等）來評估腸道菌群失調的程度。