胃腸功能紊亂引起的肚子疼的持續時間因個體差異而異，也取決于癥狀的嚴重程度和造成肚子疼的具體原因。一般情況下，輕度的胃腸功能紊亂可能只持續數小時至一天左右，而且疼痛程度相對較輕。如果癥狀較為嚴重或持續時間較長，肚子疼可能會持續數天至數周。如果肚子疼超過2周或伴隨其他嚴重癥狀（如持續嘔吐、嚴重腹瀉、大量出血等），建議及時就醫進行診斷和治療。