細菌可以分為以下三類：革蘭氏陽性細菌、革蘭氏陰性細菌和厭氧細菌。

　　1. 革蘭氏陽性細菌：這類細菌具有較粗的細胞壁，可以染上革蘭染色，顯藍紫色。革蘭氏陽性細菌包括了許多致病菌，如葡萄球菌（Staphylococcus）、鏈球菌（Streptococcus）等。

　　2. 革蘭氏陰性細菌：這類細菌具有較薄的細胞壁，不容易染上革蘭染色，顯紅色。革蘭氏陰性細菌包括了許多致病菌，如大腸桿菌（Escherichia coli）、沙門氏菌（Salmonella）等。

　　3. 厭氧細菌：這類細菌無法在常規(guī)條件下獲取氧氣進行代謝，它們可以生存于無氧環(huán)境中。厭氧細菌包括厭氧革蘭氏陽性細菌和厭氧革蘭氏陰性細菌。厭氧細菌包括了許多益生菌，如乳酸菌（Lactobacillus）和嗜酸乳桿菌（Bifidobacterium）。